Фонд «Научный потенциал» провел свой первый конкурс в сентябре 2003 года. Являясь чисто благотворительной организацией, Фонд реализует на конкурсной основе поддержку небольших научных коллективов, реально осуществляющих фундаментальные и прикладные исследования. Такая форма финансирования исследований в ряде случаев является основной формой финансовой поддержки интереснейших научных исследований.

За период с 2004 года по настоящее время Фонд активно развивал направления конкурсной поддержки ученых России. С 2006 года в отдельной номинации стали выделяться гранты молодым ученым (не старше 35 лет) в области информационных и компьютерных технологий, регулярно выделяются гранты на издание книг и монографий.

По всем видам конкурсов за указанный период было  рассмотрено более 1800 заявок, из них одобрено  - 140 проектов. В выполнении проектов, поддержанных фондом «Научный потенциал» по всем конкурсам участвовало более 500 человек. По результатам проведенных работ уже опубликовано большое количество научных публикаций и статей.